בחדרים נקיים נעשה שימוש במגוון רחב של חומרים מתכלים הממלאים תפקיד מכריע בשמירה על רמות הניקיון. חומרים מתכלים נפוצים לחדר נקי כוללים:
מגבים לחדר נקי: משמשים לניקוי ולניגוב של ציוד ומשטחים; הם מסירים ביעילות אבק וכתמים מבלי ליצור זיהום חלקיקים חדש.
מחצלות דביקות: ממוקמות בכניסות או באזורים קריטיים כדי ללכוד ולהסיר אבק וחלקיקים מאנשי או חפצים.
נייר לחדר נקי: דומה למגבים לחדר נקי אך מיועד לשימוש חד פעמי, מה שהופך את ההחלפה והסילוק נוחים.
נייר ניגוב: תוכנן במיוחד לניקוי ציוד ומשטחים מדויקים; מאופיין בייצור חלקיקים נמוך ותכונות סטטיות נמוכות.
כפפות: עשויות בדרך כלל מלטקס או ניטריל; הם מונעים מפתיתי עור ואבק אחר לזהם את הסביבה, ומבטיחים ניקיון במהלך הפעולות.
מסכות פנים: משמשות לחסימת חלקיקים נשופים; נעשה שימוש נפוץ במסכות רפואיות חד פעמיות-.
רצועות יד אנטי-סטטיות: משמשות לפיזור חשמל סטטי מגוף האדם, ומניעת נזק לציוד ולמוצרים.
ריהוט ספציפי- לחדר נקי (שולחנות וכיסאות): עשוי מחומרים ועיצובים מיוחדים שקל לנקות אותם ואינם יוצרים אבק.
סרטים מתקלפים: משמשים לאריזת מוצרים או הסרת סרטי הגנה תוך שמירה על תקני ניקיון.
בנוסף, ישנם חומרים מתכלים מיוחדים-כגון גלילים דביקים לחדר נקי ושטיחי רצפה דביקים-שנועדו לניקוי יעיל יותר של ציוד ורצפות.
הבחירה והשימוש בחומרים מתכלים אלה חייבים להתבסס על דרגת הניקיון של החדר הנקי, תהליכי הייצור ודרישות הציוד כדי להבטיח עמידה בסטנדרטים. תקנות קפדניות לגבי אחסון וניהול הן חיוניות גם כדי למנוע זיהום וזיהום- צולב.
